ขนมจีนแป้งสด ทำมาจากส่วนผสมง่ายๆ ของแป้งข้าวเจ้า น้ำ และเกลือ นวดแป้งแล้วนำไปใส่อุปกรณ์ที่บีบเส้น ในหม้อที่ต้มน้ำไว้แล้ว ขนมจีนแป้งสดมักจะนุ่มและละเอียดอ่อนกว่าขนมจีนแป้งหมัก และมีรสชาติที่เป็นกลาง นิยมนำไปเป็นเส้นผสมของส้มตำ ยำต่างมากความละมุนของเส้นจะทำให้น้ำยำ หรือรสชาติส้มตำมีความกลมกล่อมทำให้เป็นเมนูพิเศษใครหลายคนติดใจ จนต้องทานซ้ำๆ
ขนมจีนแป้งหมัก วิธีการทำคือนำข้าวมาหมักในโอ่งเป็นเวลาหลายวันก่อนที่จะรีดและนำมาทำเส้น ในระหว่างกระบวนการหมัก ส่วนผสมของแป้งข้าวจะถูกทำปฏิกิริยาชนิดหนึ่งเกิดเป็นเชื้อยีสต์หรือแบคทีเรีย ซึ่งตัวนี้จะมีส่วนทำให้ขนมจีนมีรสเปรี้ยวเล็กน้อย ขนมจีนแป้งหมักมีรสชาติที่ซับซ้อนกว่าขนมจีนแป้งสด ซึ่งส่วนมากขนมจีนแป้งหมักมักนิยมทานกับน้ำแกงต่างๆ เช่น น้ำยา น้ำเงี้ยว แกงเขียวหวานและน้ำแกงอื่นๆอีกมากมาย ทำให้รสชาติของแกงถ้วยนั้นชัดเจนโดดเด่นขึ้นได้ด้วย